本發(fā)明涉及裝置、方法和非臨時性計算機可讀介質(zhì)。
背景技術(shù):
1、專利文獻1(例如0215、0316段)等中記載了“1.為了靶rna,對熒光探針進行設(shè)計、合成以及純化。2.為了將探針(1nm)以及表面活性劑(例如zwittergent)印刷到x板上,使用biodot。3.將1滴血液涂布到基板(substrate?plate)上,關(guān)閉芯片并按壓,在室溫下培養(yǎng)1分鐘。4.將芯片插入裝置,拍攝照片,對數(shù)據(jù)進行分析?!?,“印刷的探針以及表面活性劑(例如zwittergent)在血液中溶解。表面活性劑(例如zwittergent)將紅細胞溶解,為了促進進入細胞的探針,并與靶rna結(jié)合,對白細胞進行透化處理?!?。
2、現(xiàn)有技術(shù)文獻
3、專利文獻1:日本特表2021-536019號公報
4、專利文獻2:日本特表2013-510579號公報
5、專利文獻3:日本特表2018-508228號公報
6、專利文獻4:國際公開第2019/43779號公報
7、專利文獻5:日本特許第5624487號
8、專利文獻6:日本特許第6439810號
9、專利文獻7:日本特許第5928906號
10、專利文獻8:日本特開2015-42152號
11、非專利文獻1:蓼沼等,“面向迅速微生物檢查的核酸檢測法的開發(fā)”,橫河技報vol.60,2017年,互聯(lián)網(wǎng)<url:
12、https://web-material3.yokogawa.com/19/13323/tabs/rd-tr-r06001-002.jp.pdf>
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、在本發(fā)明的第一方式中提供一種裝置,其具備:檢測部,檢測多個探針中的與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置,所述多個探針在生物芯片內(nèi)分別設(shè)置在固有位置,并且至少一部分的探針具有互相不同的堿基序列;以及學(xué)習(xí)處理部,使用學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)進行模型的學(xué)習(xí)處理,所述學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)包含與樣品中包含的核酸雜交并且由所述檢測部檢測到的探針的位置的圖案、以及具有該樣品中包含的核酸的生物的種類,所述模型根據(jù)與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置的圖案的新輸入而輸出具有該樣品中包含的核酸的生物的種類。
2、在上述的裝置中,所述學(xué)習(xí)處理部可以對探針的堿基序列和探針的固有位置中的至少一方不同的所述生物芯片的每個種類,進行分別不同的所述模型的學(xué)習(xí)處理。
3、上述任意一種裝置可以還具備:供給部,向所述模型供給與一個樣品中包含的核酸雜交并且由所述檢測部新檢測到的探針的位置的圖案;以及確定部,將根據(jù)由所述供給部供給了探針的位置的圖案而從所述模型輸出的生物的種類,確定為具有所述一個樣品中包含的核酸的生物的種類。
4、在本發(fā)明的第二方式中提供一種裝置,其具備:檢測部,檢測多個探針中的與一個樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置,所述多個探針在生物芯片內(nèi)分別設(shè)置在固有位置,并且至少一部分的探針具有互相不同的堿基序列;供給部,向模型供給由所述檢測部檢測到的探針的位置的圖案,所述模型根據(jù)與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置的圖案的輸入而輸出具有該樣品中包含的核酸的生物的種類;以及確定部,將根據(jù)由所述供給部供給了探針的位置的圖案而從所述模型輸出的生物的種類,確定為具有所述一個樣品中包含的核酸的生物的種類。
5、在具備所述確定部的上述任意一種裝置中,所述供給部可以對按照探針的堿基序列和探針的固有位置中的至少一方不同的所述生物芯片的每個種類而不同的多個所述模型中的與由所述檢測部檢測到探針的位置的生物芯片對應(yīng)的所述模型,供給由所述檢測部檢測到的探針的位置的圖案。
6、在上述任意一種裝置中,所述多個探針的至少一部分可以具有在多個種類的生物中共同的堿基序列。
7、在上述任意一種裝置中,所述多個探針可以分別具有堿基的數(shù)量為20以下的堿基序列。
8、在本發(fā)明的第三方式中提供一種方法,其具備:檢測步驟,檢測多個探針中的與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置,所述多個探針在生物芯片內(nèi)分別設(shè)置在固有位置,并且至少一部分的探針具有互相不同的堿基序列;以及學(xué)習(xí)處理步驟,使用學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)進行模型的學(xué)習(xí)處理,所述學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)包含與樣品中包含的核酸雜交并且通過所述檢測步驟檢測到的探針的位置的圖案、以及具有該樣品中包含的核酸的生物的種類,所述模型根據(jù)與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置的圖案的新輸入而輸出具有該樣品中包含的核酸的生物的種類。
9、在本發(fā)明的第四方式中提供一種方法,其具備:檢測步驟,檢測多個探針中的與一個樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置,所述多個探針在生物芯片內(nèi)分別設(shè)置在固有位置,并且至少一部分的探針具有互相不同的堿基序列;供給步驟,向模型供給通過所述檢測步驟檢測到的探針的位置的圖案,所述模型根據(jù)與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置的圖案的輸入而輸出具有該樣品中包含的核酸的生物的種類;以及確定步驟,將根據(jù)通過所述供給步驟供給了探針的位置的圖案而從所述模型輸出的生物的種類,確定為具有所述一個樣品中包含的核酸的生物的種類。
10、在本發(fā)明的第五方式中提供一種非臨時性計算機可讀介質(zhì),其中記錄有使計算機作為檢測部以及學(xué)習(xí)處理部發(fā)揮作用的程序,所述檢測部檢測多個探針中的與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置,所述多個探針在生物芯片內(nèi)分別設(shè)置在固有位置,并且至少一部分的探針具有互相不同的堿基序列,所述學(xué)習(xí)處理部使用學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)進行模型的學(xué)習(xí)處理,所述學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)包含與樣品中包含的核酸雜交并且由所述檢測部檢測到的探針的位置的圖案、以及具有該樣品中包含的核酸的生物的種類,所述模型根據(jù)與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置的圖案的新輸入而輸出具有該樣品中包含的核酸的生物的種類。
11、在本發(fā)明的第六方式中提供一種非臨時性計算機可讀介質(zhì),其中記錄有使計算機作為檢測部、供給部以及確定部發(fā)揮作用的程序,所述檢測部檢測多個探針中的與一個樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置,所述多個探針在生物芯片內(nèi)分別設(shè)置在固有位置,并且至少一部分的探針具有互相不同的堿基序列,所述供給部向模型供給由所述檢測部檢測到的探針的位置的圖案,所述模型根據(jù)與樣品中包含的核酸雜交了的探針的位置的圖案的輸入而輸出具有該樣品中包含的核酸的生物的種類,所述確定部將根據(jù)由所述供給部供給了探針的位置的圖案而從所述模型輸出的生物的種類,確定為具有所述一個樣品中包含的核酸的生物的種類。
12、另外,上述的發(fā)明的概要并未列舉本發(fā)明的必要的特征的全部。另外,這些特征組的子組合也能夠成為發(fā)明。
1.一種裝置,其特征在于,具備:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的裝置,其特征在于,
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的裝置,其特征在于,還具備:
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的裝置,其特征在于,
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的裝置,其特征在于,
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的裝置,其特征在于,
7.一種裝置,其特征在于,具備:
8.一種方法,其特征在于,具備:
9.一種方法,其特征在于,具備:
10.一種非臨時性計算機可讀介質(zhì),其特征在于,
11.一種非臨時性計算機可讀介質(zhì),其特征在于,