本發(fā)明屬于生物,具體涉及蛋白質(zhì)tabhlh92在調(diào)控小麥分蘗中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、禾谷類農(nóng)作物的產(chǎn)量由有效穗數(shù)、穗粒數(shù)和千粒重所決定。禾谷類農(nóng)作物分蘗數(shù)量很大程度上決定了有效穗數(shù)的多少,也與農(nóng)作物適應(yīng)不同環(huán)境條件(如土壤中氮素的豐缺)的能力有關(guān)。分蘗對于增加葉面積、光截獲量和光合作用至關(guān)重要,這反過來又會影響籽粒數(shù)、籽粒灌漿和產(chǎn)量。因此,分蘗能力是小麥和水稻育種過程中被選擇的重要性狀。
2、分蘗性狀由復(fù)雜且相互關(guān)聯(lián)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié),這些調(diào)控網(wǎng)絡(luò)涉及氮(n)、碳和植物激素等信號傳導(dǎo)。如獨腳金內(nèi)酯(sls)或sl衍生代謝物是分蘗芽生長的內(nèi)源性抑制劑,可通過誘導(dǎo)teosinte?branched?1(tb1)基因的表達抑制分蘗芽生長。sl生物合成和信號傳導(dǎo)對于控制小麥分蘗至關(guān)重要。在小麥中敲低sl合成通路基因tad27的表達可導(dǎo)致sl缺乏和分蘗數(shù)增加,而過表達tad27則具有相反的表型。squamosa-promoter?binding?protein-like(spl)家族成員也被證明參與sl信號傳導(dǎo),從而參與對水稻分蘗的調(diào)控。在小麥中,一些spl基因也被發(fā)現(xiàn)參與sl信號傳導(dǎo),進而影響小麥分蘗。在小麥中過表達tae-mir156可抑制taspl3/17等spl基因的表達,導(dǎo)致分蘗數(shù)量增加和小穗發(fā)育缺陷。taspl3/17與sl信號通路關(guān)鍵因子tad53互作,這種相互作用抑制了taspl3/17對tatb1基因的轉(zhuǎn)錄激活,tatb1此前已被證明可以抑制小麥的分蘗芽生長。最近,taspl3/17被發(fā)現(xiàn)與phytochrome-interacting?factor-like(pil)基因tapil1存在相互作用,而tapil1可通過轉(zhuǎn)錄激活tatb1表達抑制小麥分蘗的生長。此外,參與生長素、細胞分裂素和脫落酸(aba)生物合成和信號傳導(dǎo)的一些基因也被發(fā)現(xiàn)可以控制小麥分蘗,包括脫乙?;富騮ahst1l,生長素生物合成基因tryptophan?aminotransferase-related?tatar2.1-3a,生長素轉(zhuǎn)運體基因tapin1,terminal?flower?1基因tatfl1-5,spl轉(zhuǎn)錄因子taspl8,和ankyrin-repeatprotein編碼基因tiller?number1(tatn1)。
3、氮素和蔗糖等營養(yǎng)物質(zhì)與一些激素信號存在互作,影響分蘗的生長。蔗糖在植物體內(nèi)的遷移性及其在分蘗芽中的積累水平對于促進分蘗芽的生長至關(guān)重要。蔗糖在促進分蘗芽生長的過程中,與細胞分裂素存在協(xié)同作用,但與sl存在拮抗作用。如蔗糖可促進d53蛋白積累,進而促進水稻分蘗。蔗糖對于促進小麥分蘗也至關(guān)重要。如定位于1a染色體上的分蘗抑制位點tin1降低了分蘗芽中蔗糖含量,從而降低小麥的分蘗數(shù)。在小麥中過表達tacml20基因增加了地上部中水溶態(tài)糖含量,也增加了小麥的分蘗數(shù)。
4、氮素是植物生長發(fā)育必需的礦質(zhì)營養(yǎng)元素,施用氮肥可以增加小麥分蘗和穗數(shù),從而增加小麥產(chǎn)量。在小麥中,調(diào)控氮素吸收和利用的轉(zhuǎn)錄因子tanac2、tanfya-b1和tabzip60影響小麥分蘗數(shù)和穗數(shù);參與氮素吸收和同化的基因tanrt2.5、tags2和tanadh-gogat也影響小麥的分蘗數(shù)和穗數(shù)。但轉(zhuǎn)錄因子tabhlh92調(diào)控小麥分蘗數(shù)還未見報道。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是如何提高小麥的分蘗數(shù),以提高小麥產(chǎn)量。
2、為了解決現(xiàn)有技術(shù)存在的問題,本發(fā)明提供了蛋白質(zhì)或調(diào)控基因的表達物質(zhì)或調(diào)控所述蛋白質(zhì)活性或含量的物質(zhì)在調(diào)控植物分蘗能力中的應(yīng)用。
3、本發(fā)明提供的蛋白質(zhì)或調(diào)控基因的表達物質(zhì)或調(diào)控所述蛋白質(zhì)活性或含量的物質(zhì)在下述任一種中的應(yīng)用:
4、1)在調(diào)控植物分蘗能力中的應(yīng)用;
5、2)在制備調(diào)控植物分蘗能力的產(chǎn)品中的應(yīng)用;
6、3)在培育分蘗能力改變的植物中的應(yīng)用;
7、4)在制備培育分蘗能力改變的植物的產(chǎn)品中的應(yīng)用;
8、5)在植物育種中的應(yīng)用;
9、所述蛋白質(zhì)為如下任一所示蛋白質(zhì):
10、a1)氨基酸序列為seq?id?no:2的蛋白質(zhì);
11、a2)氨基酸序列為seq?id?no:4的蛋白質(zhì);
12、a3)氨基酸序列為seq?id?no:6的蛋白質(zhì);
13、a4)將a1)-a3)中任一所示的氨基酸序列經(jīng)過一個或幾個氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白質(zhì);
14、a5)與a1)-a4)中任一所限定的氨基酸序列具有75%以上同一性且具有相同功能的蛋白質(zhì);
15、a6)在a1)-a3)中任一所限定的蛋白質(zhì)的末端連接標簽后得到的融合蛋白。
16、上述a1)所述蛋白質(zhì)的名稱為tabhlh92。
17、為了使a1)中的蛋白質(zhì)便于純化或檢測,可在由序列表中seq?id?no:2、seq?idno:4或seq?id?no:6所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)的氨基末端或羧基末端連接標簽蛋白。
18、上述蛋白質(zhì)可人工合成,也可先合成其編碼基因,再進行生物表達得到。
19、所述標簽蛋白包括但不限于:gst(谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶)標簽蛋白、his6標簽蛋白(his-tag)、mbp(麥芽糖結(jié)合蛋白)標簽蛋白、flag標簽蛋白、sumo標簽蛋白、ha標簽蛋白、myc標簽蛋白、egfp(增強型綠色熒光蛋白)、ecfp(增強型青色熒光蛋白)、eyfp(增強型黃綠色熒光蛋白)、mcherry(單體紅色熒光蛋白)或avitag標簽蛋白。
20、本領(lǐng)域普通技術(shù)人員可以很容易地采用已知的方法,例如定向進化或點突變的方法,對本發(fā)明的編碼蛋白質(zhì)tabhlh92的核苷酸序列進行突變。那些經(jīng)過人工修飾的,具有與本發(fā)明分離得到的蛋白質(zhì)tabhlh92的核苷酸序列75%或75%以上同一性的核苷酸,只要編碼蛋白質(zhì)tabhlh92且具有蛋白質(zhì)tabhlh92功能,均是衍生于本發(fā)明的核苷酸序列并且等同于本發(fā)明的序列。
21、上述75%或75%以上同一性,可為80%、85%、90%或95%以上的同一性。
22、本文中,同一性是指氨基酸序列或核苷酸序列的同一性??墒褂脟H互聯(lián)網(wǎng)上的同源性檢索站點測定氨基酸序列的同一性,如ncbi主頁網(wǎng)站的blast網(wǎng)頁。例如,可在高級blast2.1中,通過使用blastp作為程序,將expect值設(shè)置為10,將所有filter設(shè)置為off,使用blosum62作為matrix,將gap?existence?cost,per?residue?gap?cost和lambda?ratio分別設(shè)置為11,1和0.85(缺省值)并進行檢索一對氨基酸序列的同一性進行計算,然后即可獲得同一性的值(%)。
23、本文中,所述80%以上的同一性可為至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%的同一性。
24、本文中,所述90%以上的同一性可為至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%的同一性。
25、上述應(yīng)用中,所述蛋白質(zhì)來源于小麥(triticum?aestivum?l.)。
26、本文中,調(diào)控所述蛋白質(zhì)活性和/或含量的物質(zhì)可為調(diào)控基因表達的物質(zhì),所述基因編碼所述蛋白質(zhì)tabhlh92。
27、上文中,所述調(diào)控基因表達的物質(zhì)可為進行如下6種調(diào)控中至少一種調(diào)控的物質(zhì):1)在所述基因轉(zhuǎn)錄水平上進行的調(diào)控;2)在所述基因轉(zhuǎn)錄后進行的調(diào)控(也就是對所述基因的初級轉(zhuǎn)錄物的剪接或加工進行的調(diào)控);3)對所述基因的rna轉(zhuǎn)運進行的調(diào)控(也就是對所述基因的mrna由細胞核向細胞質(zhì)轉(zhuǎn)運進行的調(diào)控);4)對所述基因的翻譯進行的調(diào)控;5)對所述基因的mrna降解進行的調(diào)控;6)對所述基因的翻譯后的調(diào)控(也就是對所述基因翻譯的蛋白質(zhì)的活性進行調(diào)控)。
28、本發(fā)明中,所述調(diào)控可為上調(diào)或增強或提高。所述調(diào)控也可為下調(diào)或減弱或降低。
29、本文中,所述增強、提高或上調(diào)受體植物中前文所述蛋白質(zhì)的編碼基因的表達量,或/和增強、提高或上調(diào)上述蛋白質(zhì)的編碼基因的活性和/或含量是通過將上述蛋白質(zhì)的編碼基因?qū)胨鍪荏w植物實現(xiàn)的。
30、本文中,所述調(diào)控所述蛋白質(zhì)的編碼基因的表達可為抑制或降低或下調(diào)所述編碼基因表達。抑制或降低或下調(diào)所述編碼基因表達可通過基因敲除或基因沉默實現(xiàn)。
31、本文中,所述基因敲除(gene?knock-out)是指通過基因編輯技術(shù)使特定靶基因失活的現(xiàn)象?;蚯贸ㄟ^dna序列的改變使特定靶基因失活,包括且不限于基于鋅指核酸酶(zinc-finger?nucleases,zfn),轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)因子核酸酶(transcriptionactivator-like?effector?nucleases,talen)和crispr/cas系統(tǒng),crispr(clusteredregulatory?interspaced?short?palindromic?repeat)即成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列,是基因組中一個含有多個短重復(fù)序列的位點,cas9蛋白在rna的介導(dǎo)下能夠?qū)rrna–tracrrna識別的靶序列進行切割。
32、本文中,所述基因沉默是指在不損傷原有dna的情況下使基因不表達或低表達的現(xiàn)象。基因沉默以不改變dna序列為前提,使基因不表達或低表達?;虺聊砂l(fā)生在兩種水平上,一種是由于dna甲基化、異染色質(zhì)化以及位置效應(yīng)等引起的轉(zhuǎn)錄水平的基因沉默,另一種是轉(zhuǎn)錄后基因沉默,即在基因轉(zhuǎn)錄后的水平上通過對靶標rna進行特異性抑制而使基因失活,包括反義rna、共抑制(co-suppression)、基因壓抑(quelling)、rna干擾(rnai)和微小rna(mirna)介導(dǎo)的翻譯抑制等。
33、上述應(yīng)用中,所述調(diào)控基因的表達物質(zhì)或調(diào)控所述蛋白質(zhì)活性或含量的物質(zhì)可為與前文所述蛋白質(zhì)相關(guān)的生物材料,所述生物材料可為下述任一種:
34、c1)編碼前文所述蛋白的核酸分子;
35、c2)含有c1)所述核酸分子的表達盒;
36、c3)含有c1)所述核酸分子的重組載體、或含有c2)所述表達盒的重組載體;
37、c4)含有c1)所述核酸分子的重組微生物、或含有c2)所述表達盒的重組微生物、或含有c3)所述重組載體的重組微生物;
38、c5)含有c1)所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物細胞系、或含有c2)所述表達盒的轉(zhuǎn)基因植物細胞系;
39、c6)含有c1)所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物組織、或含有c2)所述表達盒的轉(zhuǎn)基因植物組織;
40、c7)含有c1)所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物器官、或含有c2)所述表達盒的轉(zhuǎn)基因植物器官;
41、e1)抑制或降低或沉默前文所述蛋白編碼基因表達的核酸分子;
42、e2)含有e1)所述核酸分子的表達盒;
43、e3)含有e1)所述核酸分子的重組載體、或含有e2)所述表達盒的重組載體;
44、e4)含有e1)所述核酸分子的重組微生物、或含有e2)所述表達盒的重組微生物、或含有e3)所述重組載體的重組微生物;
45、e5)含有e1)所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物細胞系、或含有e2)所述表達盒的轉(zhuǎn)基因植物細胞系;
46、e6)含有e1)所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物組織、或含有e2)所述表達盒的轉(zhuǎn)基因植物組織;
47、e7)含有e1)所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物器官、或含有e2)所述表達盒的轉(zhuǎn)基因植物器官。
48、上述應(yīng)用中,c1)所述核酸分子可為如下任一所示的dna分子,
49、d1)編碼區(qū)序列是序列表中seq?id?no:1所示的dna分子;
50、d2)編碼區(qū)序列是序列表中seq?id?no:3所示的dna分子;
51、d3)編碼區(qū)序列是序列表中seq?id?no:5所示的dna分子;
52、d4)與d1)-d3)任一限定的核苷酸序列具有90%或90%以上同一性,且編碼權(quán)利要求1中所述蛋白的dna分子;
53、d5)在嚴格條件下與d1)-d3)任一限定的核苷酸序列雜交,且編碼前文所述蛋白的dna分子。
54、本文所述核酸分子可以是dna,如cdna、基因組dna或重組dna;所述核酸分子也可以是rna,如grna、mrna、sirna、shrna、sgrna、mirna或反義rna。
55、本文所述載體是本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的,包括但不限于:質(zhì)粒、噬菌體(如λ噬菌體或m13絲狀噬菌體等)、黏粒(即柯斯質(zhì)粒)、ti質(zhì)?;虿《据d體。具體可為載體lgy-oe3。
56、可用現(xiàn)有的植物表達載體構(gòu)建含有tabhlh92基因的重組表達載體。所述植物表達載體包括但不限于如雙元農(nóng)桿菌載體和可用于植物微彈轟擊的載體等。所述植物表達載體還可包含外源基因的3′端非翻譯區(qū)域,即包含聚腺苷酸信號和任何其它參與mrna加工或基因表達的dna片段。所述聚腺苷酸信號可引導(dǎo)聚腺苷酸加入到mrna前體的3′端,如包括但不限于農(nóng)桿菌冠癭瘤誘導(dǎo)(ti)質(zhì)粒基因(如胭脂合成酶nos基因)、植物基因(如大豆貯藏蛋白基因)3′端轉(zhuǎn)錄的非翻譯區(qū)均具有類似功能。
57、使用tabhlh92基因構(gòu)建重組植物表達載體時,在其轉(zhuǎn)錄起始核苷酸前可加上任何一種增強型啟動子或組成型啟動子,包括但不限于如花椰菜花葉病毒(camv)35s啟動子、玉米的泛素啟動子(ubiquitin),它們可單獨使用或與其它植物啟動子結(jié)合使用;此外,使用本發(fā)明的基因構(gòu)建植物表達載體時,還可使用增強子,包括翻譯增強子或轉(zhuǎn)錄增強子,這些增強子區(qū)域可以是atg起始密碼子或鄰接區(qū)域起始密碼子等,但必需與編碼序列的閱讀框相同,以保證整個序列的正確翻譯。所述翻譯控制信號和起始密碼子的來源是廣泛的,可以是天然的,也可以是合成的。翻譯起始區(qū)域可以來自轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域或結(jié)構(gòu)基因。
58、為了便于對轉(zhuǎn)基因植物細胞或植物進行鑒定及篩選,可對所用植物表達載體進行加工,如加入包括但不限于可在植物中表達的編碼可產(chǎn)生顏色變化的酶或發(fā)光化合物的基因(gus基因、熒光素酶基因等)、具有抗性的抗生素標記物(慶大霉素標記物、卡那霉素標記物等)或是抗化學試劑標記基因(如抗除草劑基因)等。從轉(zhuǎn)基因植物的安全性考慮,可不加任何選擇性標記基因,直接以逆境篩選轉(zhuǎn)化植株。
59、利用任何一種可以引導(dǎo)外源基因在植物中表達的載體,將本發(fā)明所提供的tabhlh92基因或基因的片段導(dǎo)入植物細胞或受體植物,可獲得分蘗能力改變的轉(zhuǎn)基因細胞系及轉(zhuǎn)基因植株。攜帶tabhlh92基因的表達載體可通過使用ti質(zhì)粒、ri質(zhì)粒、植物病毒載體,直接dna轉(zhuǎn)化、顯微注射、電導(dǎo)、農(nóng)桿菌介導(dǎo)等常規(guī)生物學方法轉(zhuǎn)化植物細胞或組織,并將轉(zhuǎn)化的植物組織培育成植株。
60、可選地,e2)所述的表達盒為攜有seq?id?no:7所示dna分子的表達盒。
61、本發(fā)明還提供了一種提高植物分蘗能力的方法,所述方法包括步驟m,所述步驟m為抑制或降低或沉默目的植物中前文所述蛋白的活性和/或含量,或/和,抑制或降低或沉默前文所述蛋白的編碼基因的表達量,來提高植物分蘗能力。
62、本發(fā)明還提供了一種降低植物分蘗能力的方法,所述方法包括步驟p,所述步驟p為增強、提高或上調(diào)目的植物中前文所述蛋白的活性和/或含量,或/和,增強、提高或上調(diào)前文所述蛋白的編碼基因的表達量,來降低植物分蘗能力。
63、上述方法中,所述降低目的植物中所述蛋白質(zhì)tabhlh92的編碼基因的表達量和/或活性可為利用基因突變、基因敲除、基因編輯或基因敲減技術(shù)使目的植物基因組中所述蛋白質(zhì)tabhlh92的編碼基因活性下降或失活。
64、本發(fā)明提供一種培育分蘗能力提高的植物的方法,包括抑制或降低或沉默目的植物中上述蛋白的編碼基因的表達和/或上述蛋白的含量和/或活性,或/和抑制或降低或沉默上述蛋白質(zhì)的編碼基因的活性和/或含量,得到分蘗能力提高的植物。
65、在本發(fā)明的一個實施方案中,所述培育分蘗能力提高植物的育種方法包括如下步驟:
66、(1)構(gòu)建抑制或降低或沉默前文所述蛋白質(zhì)的編碼基因的重組表達載體;
67、(2)將步驟(1)構(gòu)建的重組表達載體轉(zhuǎn)入受體植物中,獲得分蘗能力高于所述受體植物的植物。
68、本發(fā)明中,所述調(diào)控蛋白質(zhì)tabhlh92表達具體可為小麥苗期地上部和根系中tabhlh92表達。
69、本發(fā)明中,所述植物育種的目的可包括培育分蘗能力提高的植物。
70、本發(fā)明中,所述分蘗能力體現(xiàn)在分蘗芽的生長或/和分蘗數(shù)。
71、本發(fā)明中,所述分蘗能力還包括在高氮或/和低氮培養(yǎng)條件下的分蘗能力。
72、所述高氮條件為2mm?n,所述低氮條件為0.2mm?n。
73、本發(fā)明中,所述植物可為如下任一種:
74、n1)雙子葉植物:
75、n2)禾本目植物;
76、n3)禾本科植物;
77、n4)小麥屬植物;
78、n5)小麥。
79、本發(fā)明中,所述小麥可為小麥品種科農(nóng)199。
80、本發(fā)明通過降低tabhlh92來調(diào)控小麥的分蘗能力,小麥根系和地上部中tabhlh92的表達受到高供氮水平的抑制。tabhlh92可負調(diào)控不同供氮水平下的小麥分蘗數(shù),通過rnai方法降低tabhlh92表達量可以顯著增加不同供氮水平下的分蘗數(shù),從而為提高不同供氮水平下小麥產(chǎn)量奠定基礎(chǔ),達到節(jié)肥增產(chǎn)和保護環(huán)境的目標。